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古朵新聞:核結構在細胞核中組織基因組的是什么?

閱讀:62          發布時間:2019-6-10

細胞核中活性與基因組無活性部分的空間分離對于基因表達控制至關重要。一項新的研究揭示了這種分離的主要機制,并將我們對核心的描述顛倒過來。

真核染色體由染色質構成,染色質是DNA和相關蛋白的復合物。根據轉錄活性和壓實程度,可以區分兩種類型的染色質,這兩種類型在細胞核內在空間上分開。高度濃縮的部分由染色質區域組成,其含有很少的基因并且是轉錄失活的。

它被稱為異染色質,位于細胞核的外圍,靠近核膜。另一方面,常染色質富含基因并且對應于基因組的活性部分。它占據細胞核的內部區域,密度較小,因此基因表達所需的蛋白質機器更容易接近。這種基因組組織的一般模式幾乎存在于所有真核細胞類型中,

由位于慕尼黑的Ludwig-Maximilians-Universitaet(LMU)的Irina Solovei*的團隊與Job Dekker(馬薩諸塞大學醫學院)和麻省理工學院Leonid Mirny的物理學家(醫學工程研究所)合作開展的研究和科學)現在表明染色質分離的驅動力是無活性的異染色質,并且常染色質和異染色質的“默認”染色質分布是相反的。新發現發表在“自然”雜志上。

已經提出了許多機制來解釋染色質如何在細胞核內分離,但是它們中沒有一個是決定性的,主要是因為很難分析兩種染色質類型在常規細胞核中的相互作用,其中異染色質拴在核膜上。“因此,對于我們的研究,我們選擇了所謂的倒置細胞核,”Solovei說。她和她的慕尼黑同事大約10年前在夜間活動的哺乳動物的視網膜中發現了這些細胞核,在那里它們被限制為被稱為視桿細胞的感光細胞類型。

在棒中,緊密凝聚的異染色質包裝在細胞核內部,而活性常染色質直接位于核膜下 - 這是一般規則的一個*例外。結果表明,桿狀核的異染色質核心充當微透鏡會聚光,從而改善夜間視網膜的光學特性。來自同一組的后續研究揭示了這種非典型核缺乏兩種蛋白質復合物的反轉機制,這兩種蛋白質復合物通常將異染色質連接到核膜的內層表面,即核層。

利用現代顯微鏡和分子生物學技術相結合的數據,研究人員現在已經生成了單個染色體和整個細胞核的聚合物模型。通過模擬這些聚合物在不同條件下的行為,他們能夠研究兩種染色質組分和核層之間和之間相互作用的作用。這些研究表明單獨的異染色區域之間的相互作用足以進行染色質分離,而常染色質中的相互作用對于該過程是不必要的。

“我們的研究結果表明,倒核在概念上代表了默認的核結構,”米爾尼說。“雖然異染色質與核層的相互作用對于建立傳統建筑至關重要。”“在這方面,”Solovei說,“有趣的是,為什么大多數真核生物都具有常規核,以及異染色質在核周邊定位的功能相關性是多么令人感興趣。”

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