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技術(shù)文章

超純質(zhì)粒制備操作細則 古朵生物√

閱讀:77          發(fā)布時間:2021-3-23

1溶液配制:

1.1 Buffer P1:(懸浮用)

  成分:50mM Tris.HCl, pH8.0, 10mM EDTA, 100ug/mL Rnase A

  配制:

  2M Tris.HCl, pH 8.0  25mL

  0.5M EDTA, pH 8.0  20mL

雙蒸水至 1L,滅菌。

使用前每1L buffer加入100mg RNAse A,并于4℃保存。

1.2 Buffer P2:(裂解用)

  成分:200mM NaOH, 1% SDS

  配制:

  8g NaOH固體溶解于500mL雙蒸水中,成0.4M NaOH溶液

  10g SDS溶于500mL雙蒸水中,成2% SDS溶液

  使用前將上述兩種溶液等體積混合后使用

  注意:

    Buffer P2混合后不宜放置時間過場,每次配夠一周使用的即可。長時間放置容易產(chǎn)生沉淀。若有沉淀產(chǎn)生,在37℃保溫一段時間使沉淀溶解。

1.3 Buffer P3:(中和用)

  成分:3M KAc(醋酸鉀),pH4.8

  配制:將147g KAc 溶于350mL雙蒸水中,用約60mL冰醋酸調(diào)節(jié)PH值,然后繼續(xù)用濃鹽酸調(diào)節(jié)pH值至約5左右.蕞后定容至500mL。

1.4 Buffer QBT:(平衡用)

成分:750mL NaCl; 50mM MOPS.Ph7.0;15% 異丙醇,0.15% Triton X-100

配制:溶解43.83g NaCl, 10.46g MOPS到800 mL 雙蒸水中,調(diào)節(jié)pH值至7.0,然后加入150mL 異丙醇和15Ml Triton X-100,加水定容至1L。

1.5 Buffer QC:(洗滌用)

成分:1.0 M NaCl,50Mm MOPS, Ph7.0

配制:溶解58.44g NaCl, 10.46 MOPS至800 mL 雙蒸水中,調(diào)節(jié)pH值至7.0,然后加入150mL異丙醇,定容至1L。

2 Qiagen-tip 20質(zhì)粒小量提取操作步驟

2.1 取過夜培養(yǎng)的菌液2mL,12000rpm離心30秒至1分鐘,去凈上清。

2.2用0.3mL Buffer P1重新充分懸浮沉淀。

2.3加入0.3mL Buffer P2,輕輕顛倒搖勻,室溫下放置5分鐘。

注意:此步不應劇烈振蕩,否則容易在所提質(zhì)粒中混入基因組DNA。

2.4 Buffer P2使用后應蓋緊蓋子,否則NaOH易與空氣中的CO2起反應。

2.5 加入0.3mL Buffer P3,輕輕混勻,于4℃冰箱中放置10分鐘。

12000rpm高速離心15分鐘。

2.6 用1mL Buffer QBT平衡Qiagen-tip 20柱,并讓QBT慢慢流下。

2.7 將步驟5所得的上清倒入已平衡好的Qiagen-tip 20柱,讓其慢慢流下。

2.8 每次用1mL QC清洗Qiagen-tip 20柱,清洗3次。

2.9用0.8mL QF洗脫DNA。

2.10 用0.6倍體積(500uL)的異丙醇沉淀質(zhì)粒,顛倒混勻,室溫放置5分鐘,12000rpm高速離心15分鐘。

2.11去上清,用1mL 70%乙醇洗滌沉淀,12000rpm高速離心3分鐘,去凈上清。

2.12重復步驟11一次。

注意:洗滌時,每次用吸水紙吸一下,盡量去凈殘余的液體。

去凈上清很重要,否則除不凈多余的鹽分,將嚴重影響的后面的測序反應。

2.13 抽干多余的乙醇,用30~50uL雙蒸水溶解DNA,取2uL電泳檢測定量,用于測序。

3 Qiagen-tip 20柱子的清洗處理

3.1用5mL緩沖液清洗柱子,洗去多余的DNA及其他雜質(zhì),備用。

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