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數字實時 PCR QuantStudio 3D

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產品簡介

AppliedBiosystemsQuantStudio3D數字PCR系統是一個簡單、經濟實惠的平臺,采用密封芯片技術,為進行數字PCR提供了高效、可靠和穩定的方法。基于一站式芯片的工作流程讓您可以加載芯片、密封并繼續擴增。

詳細介紹

QuantStudio 3D 數字實時 PCR 系統

經濟實惠、緊湊易用的數字 PCR 系統。

 

概述

Applied Biosystems QuantStudio 3D 數字 PCR 系統是一個簡單、經濟實惠的平臺,采用密封芯片技術,為進行數字 PCR 提供了高效、可靠和穩定的方法。基于一站式芯片的工作流程讓您可以加載芯片、密封并繼續擴增。

 

QuantStudio 3D 系統擴展了傳統實時 PCR 的界限,可以定量,無需使用標準曲線。

 

特點

QuantStudio 3D 數字系統提供: 

每個芯片20,000個納米級反應孔 與基于液滴的方法相比,樣品加載控制更佳,未完成的反應更少,從而確保定量的更高精度

一次熱循環多達24個芯片 QuantStudio 3D 數字 PCR 系統只需不到30秒即可讀取每個芯片,從而利用簡單、高效的工作流程來進行數字 PCR。 

基于芯片的一站式工作流程 簡單的工作流程;只需加載和密封即可進行 PCR 和分析,如下所示:

 

樣品數據

QuantStudio 3D 數字 PCR 系統精度

利用 8個assay的TaqMan 基因表達Assay Panel擴增五個獨立的重復。所有檢測值均在相應平均值(綠線)的 ±10%(紅線)范圍內。(A) 低水平基因表達的結果(HPRT1、MYC 和 VEGFA)。(B) 高水平基因表達的結果(18S、B2M、GAPDH、GUSB 和 PPIA)。

QuantStudio 3D 數字 PCR 系統的準確度

經過評估,QuantStudio 3D 數字 PCR 系統定量的準確度與兩種正交定量方法一致。使用男性基因組 DNA,利用 QuantStudio 12K Flex OpenArray 數字 PCR 板 (OA) 上的 UV 分光光度計和數字 PCR 測定兩種濃度的拷貝數/μL,并在 QuantStudio 3D 數字 PCR 系統 (QS3D) 上測定5個技術重復兩種濃度的拷貝數/μL,然后進行對比。兩種樣品的預期目標濃度為300個拷貝/μL 和1,500個拷貝/μL,均在預期值范圍內,而 QuantStudio 3D 數字 PCR 系統得出的檢測結果與其他方法相比具有的精度。

9份獨立 DNA 樣品(相當于0–8個拷貝)中,對17號染色體上的 CCL3L1 基因位點的拷貝數分析所顯示的精度和準確度。

(A) 實驗設計和所檢測樣品組的結果數據。每個數字 PCR 檢測值均落在預期值的標準差范圍內。值得注意的是,所有檢測值變異系數 (CV) 均小于2.55%,充分表明可以達到很高的精度。

(B) A 中所顯示相同數據的圖形表現。由于達到很高的精度,數字 PCR 結果可以區分出含有7個拷貝和8個拷貝的樣品。

 

通過數字 PCR 進行 KRAS 微量等位基因定量的示例在 QuantStudio 3D 數字 PCR 系統上,利用針對數字 PCR 進行了優化的定制 TaqMan SNP 基因分型分析檢測 KRAS G12V 突變。

每份樣品的結果表示突變質粒在野生型基因組 DNA 中的比例。0.1%目標表示在野生型基因組 DNA 背景中的突變細胞系中的突變基因組 DNA。所有樣品均使用配備相對定量模塊的 QuantStudio 3D AnalysisSuite Cloud Software 進行分析。(A) 目標檢出突變率為10%。突變檢出率為10.384%,置信區間為8.235–13.076%。(B) 目標檢出突變率為1%。突變檢出率為1.393%,置信區間為0.772–2.507%。(C) 目標檢出突變率為0.1%。突變檢出率為0.142%,置信區間為0.064–0.310%。(D) 野生型對照樣品。

 

性能數據

QuantStudio 3D 數字 PCR 儀器

讀取一份樣品的時間

30秒

PCR 檢測方法

終點

樣品光源

LED

樣品檢測

CMOS

檢測通道

FAM/SYBR Green、VIC、ROX

讀取器尺寸(高 x 寬 x 深)

21 x 13.5 x 23.25 cm(8.3 x 5.3 x  9.15 英寸)

重量

2.4 kg(5.3磅)

QuantStudio 3D 數字 PCR 20K 芯片

分區

芯片反應孔

每個芯片的樣品

1

每個芯片的目標

2

熱循環儀中的芯片容量

24

每份樣品的反應孔

20,000

加載體積

14.5 μL

密封工作流程

性能

動態范圍

5個對數級

95%置信區間的精度

±10%

兼容的化學品

TaqMan 和 SYBR Green 化學品

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